基于基因测序数据，中山大学肿瘤防治中心徐瑞华教授研究团队建立了首分子分型体系，为晚期食管鳞癌“免疫治疗抗体联合化疗”的一线治疗方案提供了更精确的决策工具。近日，相关研究论文在肿瘤学国际期刊《癌症细胞》上在线发表。
食管癌主要包括腺癌和鳞癌，其中鳞癌为常见，占食管癌的85%。过去，晚期食管鳞癌的治疗以单纯化疗方案为主，但患者生存获益有限，预后不佳。近年来，多项大型3期随机对照研究证实，“PD-1抗体联合化疗”的免疫模式能让晚期食管癌患者获益。但是，对于PD-L1低表达和高表达的患者来说，两者的临床获益情况存在争议。而徐瑞华团队曾研究发现，PD-L1表达水平作为疗效标志物的应用价值有限，需寻求更为可靠的疗效标志物。
在此次研究中，研究团队基于大型临床队列（JUPITER-06）开展了前瞻性临床转化研究，对486名食管鳞癌患者的治疗前肿瘤组织进行全外显子测序。论文共同通讯作者之一、中山大学肿瘤防治中心王峰教授介绍，免疫原性和风险致瘤变异是影响免疫治疗获益的主要因素，所以，研究团队从这两方面开展研究。
在免疫原性方面，研究团队发现，在既往的免疫治疗疗效预测过程中，肿瘤突变负荷（TMB）和肿瘤克隆性突变负荷均无法有效预测疗效。研究人员对克隆性突变发生区域的拷贝数变异情况做出分类，并根据推断的拷贝数变异和突变发生的先后关系，将突变定义为“早型”和“晚型”，再通过数据分析矫正得到数据模型ccTMB。验证结果显示，ccTMB评分数值高的患者从化疗联合PD-1抗体中的获益，优于评分数低的患者。
人类白细胞抗原（HLA）分子同样影响肿瘤细胞的免疫原性。研究团队发现，人类白细胞抗原亚型HLA-B和HLA-Ⅱ的多样性，以及非HLA-B1501的HLA-B62超型是正性疗效预测标志物，联合ccTMB可以进一步构成优化的免疫原性指标，提高预测效能。
在风险致瘤变异方面，部分基因组致瘤变异已被证实与PD-1抗体单药耐药相关。研究团队进一步对突变基因和发生拷贝数变异进行筛选，发现TET2突变、PIK3CA突变、染色体1q21.3区段扩增和染色体22q11.21区段扩增，与晚期患者对PD-1抗体联合化疗耐药相关。
在这些结论的基础上，研究人员构建出新的EGIC分型（食管癌基因组肿瘤免疫分型）：将免疫原性有利于联合治疗且风险致瘤变异阴性的患者定义为EGIC1型，75%以上的该型患者在化疗联合PD-1抗体治疗中持续获益；将免疫原性有利于联合治疗或风险致瘤变异阴性的患者定义为EGIC2型，该型患者在联合模式中也有一定的获益；将免疫原性不利于联合治疗或风险致瘤变异阳性的患者定义为EGIC3型，该型患者无法在化疗联合PD-1抗体中获益。对于EGIC3型患者，通过联合靶向干预所携带的风险致瘤变异分子事件可能是进一步提高治疗获益的可行策略。
食管癌主要包括腺癌和鳞癌，其中鳞癌为常见，占食管癌的85%。过去，晚期食管鳞癌的治疗以单纯化疗方案为主，但患者生存获益有限，预后不佳。近年来，多项大型3期随机对照研究证实，“PD-1抗体联合化疗”的免疫模式能让晚期食管癌患者获益。但是，对于PD-L1低表达和高表达的患者来说，两者的临床获益情况存在争议。而徐瑞华团队曾研究发现，PD-L1表达水平作为疗效标志物的应用价值有限，需寻求更为可靠的疗效标志物。
在此次研究中，研究团队基于大型临床队列（JUPITER-06）开展了前瞻性临床转化研究，对486名食管鳞癌患者的治疗前肿瘤组织进行全外显子测序。论文共同通讯作者之一、中山大学肿瘤防治中心王峰教授介绍，免疫原性和风险致瘤变异是影响免疫治疗获益的主要因素，所以，研究团队从这两方面开展研究。
在免疫原性方面，研究团队发现，在既往的免疫治疗疗效预测过程中，肿瘤突变负荷（TMB）和肿瘤克隆性突变负荷均无法有效预测疗效。研究人员对克隆性突变发生区域的拷贝数变异情况做出分类，并根据推断的拷贝数变异和突变发生的先后关系，将突变定义为“早型”和“晚型”，再通过数据分析矫正得到数据模型ccTMB。验证结果显示，ccTMB评分数值高的患者从化疗联合PD-1抗体中的获益，优于评分数低的患者。
人类白细胞抗原（HLA）分子同样影响肿瘤细胞的免疫原性。研究团队发现，人类白细胞抗原亚型HLA-B和HLA-Ⅱ的多样性，以及非HLA-B1501的HLA-B62超型是正性疗效预测标志物，联合ccTMB可以进一步构成优化的免疫原性指标，提高预测效能。
在风险致瘤变异方面，部分基因组致瘤变异已被证实与PD-1抗体单药耐药相关。研究团队进一步对突变基因和发生拷贝数变异进行筛选，发现TET2突变、PIK3CA突变、染色体1q21.3区段扩增和染色体22q11.21区段扩增，与晚期患者对PD-1抗体联合化疗耐药相关。
在这些结论的基础上，研究人员构建出新的EGIC分型（食管癌基因组肿瘤免疫分型）：将免疫原性有利于联合治疗且风险致瘤变异阴性的患者定义为EGIC1型，75%以上的该型患者在化疗联合PD-1抗体治疗中持续获益；将免疫原性有利于联合治疗或风险致瘤变异阴性的患者定义为EGIC2型，该型患者在联合模式中也有一定的获益；将免疫原性不利于联合治疗或风险致瘤变异阳性的患者定义为EGIC3型，该型患者无法在化疗联合PD-1抗体中获益。对于EGIC3型患者，通过联合靶向干预所携带的风险致瘤变异分子事件可能是进一步提高治疗获益的可行策略。
